永历十三年二月十九，齐王府与地方各省的官员轮换调整彻底完成，休整数日后，陈文便下达了召开齐王府下属机构制度改革会议的命令。
官制改革，是陈文早已有心为之的事情。奈何此前，江浙明军集团对控制区各地，尤其是新近收复的那几个省的控制能力还没有达到适宜官制改革的水平，江南也还有大量的反对派士绅存在，所以才会迁延至今。
但是到了今时今日，通过湖广分省、迁移贵州军户、废除地方官府屯田权限、打击江南士绅、厉行浙江新政以及长期镇守等一系列手段，对于控制区的掌控力度已经达到了足够的水平，总算是时机成熟。
“随着控制区的扩大和事务的繁琐化，齐王府旧有机构已经不敷使用。是故，自永历十三年三月起，齐王府下属新设审官、度支、营造、陆军和海军五司。”
“审官司总长，由原浙江巡抚孙钰担任，该司负责齐王府下属各司及各省之文官任用、罢黜……”
“坐落于浙江杭州的文官训练班迁址南京，划归宣教司管理，宣教司负责训练事务，不得插手隶属于审官司的人事任用……”
文官训练班最早是在金华府，后来随着杭州重新恢复省会的地位，以及负责文官训练班的浙江巡抚孙钰北上，文官训练班也迁址到杭州。现如今，孙钰改任审官司总长，手握人事任免大权，文官训练班自然不方便再划归审官司管理，改由宣教司负责训练事务，审官司负责任用，也是应有之义。
“度支司总长，由原江西巡抚王江担任，该司负责齐王府下属各司及各省之税收、财计统筹、支出等事……”
财务是国之大事，财政方面的总负责人往往都有着计相之称。原本，齐王府是有一系列相关机构的，甚至度支司的下属部门也大多是旧有的，但是此前陈文却并没有建立这么一个专门的部门，而是直接负责。现如今，地盘越来越大，也是需要一个长于此务的专业人才来管理起来。
人事和财政是官府的两个最重要的部门，陈文分别分明了孙钰和王江负责，也并没有出乎与会人员的意料之外。孙钰始终负责文官训练班，接受人事管理是顺理成章；而王江则是老资格的理财专家，无论是当年在大兰山上，还是这几年在江西，财计一事都是人所称道的，更是没什么好奇怪的。
“营造司总长，由原南赣巡抚顾守礼担任，该司负责屯田、水利、营缮、机械研发和制造……”
“各省屯田、各苦力营皆划归营造司管理，金华机械制造工坊、南昌农具机械制造工坊、江西景德镇御器坊、南京织造局、杭州织造局及苏州织造局等工坊划归营造司管理。另，军工司下属工坊仍由军工司负责直接管理，营造司不得插手、干预……”
顾守礼是陈文最早的幕僚之一，更是江浙明军集团的第三个巡抚一级的文官，此番接掌营造司，倒不像孙钰和王江那般，但是一任司一级文官也是再正常不过的了。
接下来的两个司，陆军司和海军司则是比较新鲜的机构，分别负责陆军各师、各营以及地方驻军和海军东海舰队、南海舰队、长江巡航舰队以及各省内河舰队的军官、士卒的选授、简练、镇戍、厩牧、邮传、舆皂等事。
“除此五司以外，原有之宣教司、提点刑狱司、参谋司、监军司、军法司、军训司、军需司、军工司、军情司、监察司等各司职能基本不变，各省都督府仍直接向齐王府负责。坐落于金华的浙江新式陆军讲武学堂和坐落于宁波的浙江新式海军讲武学堂划归于军训司管辖，不再由宣教司负责……”
由旧卫所改组成为肩负着后世人武部职能各省都督府是有初级训练职能存在的，但是他们更重要的职能是管理各地军户，尤其是其中的备补兵，权利比起人武部是要更大的。例如这一次与江南士绅决战，就是输出货物的各省都督府选派备补兵随行。
无论古今中外，为防止令正常国家闻风丧胆的军国体制的形成，对于军队往往是通过征调、作训和保障这三方面职权划分来实现三权分立制衡。这个原理在宋时既是枢密使、指挥使和转运使，在后世的共和国便是总政治部、总参谋部和总后勤部，便是在外国在道理上也都是大致相同的，差别无非是称呼和细微的方面而已。
明时最初是文武殊途，军队由兵部负责征调、由大都督府和后来的五军都督府负责作训、由地方卫所负责保障，军方的自由度较大，不必在供给上向文官低头。但是等到文官彻底压倒武将，五军都督府的职能被文官侵蚀，地方卫所的制度败坏，一切就进入到了国家稳定时期文官掌控一切——只要中央政府对武将的掌控能力下降，武将在地方上就会出现转化为藩镇的危险，崇祯朝的关宁军乃至末期的楚镇左良玉以及弘光朝的江北四镇、福建郑芝龙都是同样的道理。
陈文的新制度还没有彻底完成，很多部门的存在意义都是为了接下来的战事存在，陈文亲自负责军务，军务方面的各司细化，这样陈文才能如臂使指的应对各方面的威胁，尤其是他还有着更多不同手段的情况之下。
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